傳統的杜牙根治療通常由牙科醫生在肉眼下進行，主要依賴經驗和手感進行操作，而在昏暗的視野下完成治療。然而，牙齒內的牙髓神經如髮絲般，非常細小，透過顯微根管治療，牙科醫生可以更準確地使用器械進入根管深處進行操作，提升根管治療的品質。

• 透過放大目標牙齒並提供充足光源，可以更清楚地觀察牙齒內部。
• 確認手術位置，減少治療過程中的不確定性，降低治療失敗的風險。
• 可以針對病情進行精準治療，同時最大程度地減少對傷口及周圍健康組織的損害。
• 在過去許多必須拔除的牙齒中，透過顯微鏡的應用，大大提高了保留牙齒的機會。

現今牙科的主要趨勢是強調「保留健康的天然牙齒」作為首要治療目標。畢竟，無論多麼精巧，假牙終究不如自己的牙齒。若患者符合以下幾種情況之一，牙科醫生可能會建議考慮進行顯微根管治療：

• 有特殊根管型態的牙齒：針對牙齒個別型態，進行更完整的清創，提高根管治療的質量，如C型根管、特別彎曲之根管、牙中牙、牛狀齒等
• 具有根管鈣化現象的患者：有些牙齒根管非常細小，且內部已經鈣化，形成了阻礙牙科醫生進行根管清潔的障礙。這種情況治療難度較高，需要借助顯微鏡來進行治療。
• 根管重新治療 – 曾接受過二次根管治療的牙齒：有些牙齒可能多年前已接受過一次根管治療，但未能完全清除牙髓中的細菌，因此需要進行二次根管治療或移除輔助根管充填物或其他異物，包括折損的器械、銀針、棉花、黏著劑等。
• 協助診斷裂齒（牙齒斷裂）、牙根吸收、協助治療根管管璧破損及開放性牙根尖。